Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TtrP07309 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TtrP07309 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TtrP07309 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TtrP07309 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TtrP07309 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TtrP07309 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TtrP07309 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TtrP07309 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TtrP07309 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TtrP07309 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TtrP07309 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TtrP07309 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TtrP07309 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TtrP07309 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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TtrP07309 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TtrP07309 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtrP07309 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtrP07309 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtrP07309 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtrP07309 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtrP07309 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtrP07309 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TtrP07309 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TtrP07309 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TtrP07309 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TtrP07309 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtrP07309 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtrP07309 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtrP07309 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtrP07309 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TtrP07309 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TtrP07309 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TtrP07309 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TtrP07309 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TtrP07309 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TtrP07309 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TtrP07309 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TtrP07309 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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