Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CfhP06909 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CfhP06909 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CfhP06909 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CfhP06909 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CfhP06909 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CfhP06909 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CfhP06909 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CfhP06909 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CfhP06909 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CfhP06909 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CfhP06909 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CfhP06909 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CfhP06909 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CfhP06909 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CfhP06909 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CfhP06909 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CfhP06909 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CfhP06909 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CfhP06909 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CfhP06909 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CfhP06909 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CfhP06909 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CfhP06909 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CfhP06909 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CfhP06909 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CfhP06909 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CfhP06909 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CfhP06909 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CfhP06909 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CfhP06909 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CfhP06909 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CfhP06909 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CfhP06909 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CfhP06909 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CfhP06909 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CfhP06909 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CfhP06909 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CfhP06909 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CfhP06909 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CfhP06909 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CfhP06909 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CfhP06909 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CfhP06909 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CfhP06909 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CfhP06909 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CfhP06909 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CfhP06909 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CfhP06909 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CfhP06909 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CfhP06909 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CfhP06909 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CfhP06909 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CfhP06909 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CfhP06909 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CfhP06909 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CfhP06909 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CfhP06909 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CfhP06909 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CfhP06909 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CfhP06909 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CfhP06909 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CfhP06909 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CfhP06909 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CfhP06909 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CfhP06909 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CfhP06909 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CfhP06909 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CfhP06909 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CfhP06909 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CfhP06909 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CfhP06909 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CfhP06909 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CfhP06909 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CfhP06909 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CfhP06909 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CfhP06909 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms