Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt1P04104 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt1P04104 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt1P04104 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt1P04104 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt1P04104 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms