Protein–RNA interactions for Protein: P01799

Ig heavy chain V-III region ABE-47N, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01799 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01799 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01799 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01799 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01799 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01799 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01799 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01799 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01799 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01799 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01799 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01799 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01799 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01799 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01799 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01799 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01799 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01799 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01799 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01799 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01799 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01799 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01799 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01799 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01799 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01799 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01799 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01799 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01799 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01799 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01799 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01799 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01799 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01799 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms