Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01790 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01790 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01790 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01790 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01790 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01790 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01790 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01790 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01790 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01790 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01790 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01790 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01790 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
P01790 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01790 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01790 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01790 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01790 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms