Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01788 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01788 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01788 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01788 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01788 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01788 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01788 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01788 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01788 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01788 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01788 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01788 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
P01788 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01788 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01788 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01788 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01788 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01788 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01788 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01788 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01788 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01788 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01788 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01788 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01788 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01788 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01788 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01788 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01788 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01788 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01788 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01788 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01788 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01788 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01788 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms