Protein–RNA interactions for Protein: P01674

Ig kappa chain V-III region PC 2154, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01674 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01674 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01674 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01674 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01674 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01674 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01674 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01674 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01674 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01674 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01674 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01674 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01674 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01674 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01674 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01674 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01674 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01674 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01674 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01674 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms