Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01659 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01659 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01659 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01659 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01659 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01659 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01659 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01659 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01659 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01659 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01659 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01659 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01659 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01659 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01659 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01659 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01659 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01659 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01659 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01659 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01659 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01659 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01659 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01659 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms