Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms