Protein–RNA interactions for Protein: P00405

Mtco2, Cytochrome c oxidase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco2P00405 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtco2P00405 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms