Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Casp8O89110 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms