Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Robo1O89026 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Robo1O89026 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Robo1O89026 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Robo1O89026 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Robo1O89026 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Robo1O89026 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Robo1O89026 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Robo1O89026 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Robo1O89026 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Robo1O89026 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms