Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JtbO88824 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JtbO88824 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JtbO88824 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JtbO88824 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JtbO88824 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
JtbO88824 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
JtbO88824 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
JtbO88824 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JtbO88824 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JtbO88824 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms