Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tom1O88746 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tom1O88746 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tom1O88746 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tom1O88746 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tom1O88746 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tom1O88746 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tom1O88746 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tom1O88746 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tom1O88746 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tom1O88746 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tom1O88746 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms