Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms