Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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