Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntsr1O88319 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ntsr1O88319 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ntsr1O88319 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ntsr1O88319 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ntsr1O88319 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ntsr1O88319 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ntsr1O88319 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms