Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms