Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atf5O70191 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf5O70191 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf5O70191 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf5O70191 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf5O70191 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf5O70191 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf5O70191 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf5O70191 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf5O70191 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms