Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna4O70174 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna4O70174 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms