Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SncaO55042 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SncaO55042 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaO55042 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaO55042 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaO55042 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaO55042 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaO55042 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaO55042 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaO55042 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaO55042 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaO55042 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaO55042 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncaO55042 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncaO55042 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncaO55042 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncaO55042 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncaO55042 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncaO55042 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncaO55042 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SncaO55042 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncaO55042 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncaO55042 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SncaO55042 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SncaO55042 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SncaO55042 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SncaO55042 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SncaO55042 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SncaO55042 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SncaO55042 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SncaO55042 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SncaO55042 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SncaO55042 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SncaO55042 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SncaO55042 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SncaO55042 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SncaO55042 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SncaO55042 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SncaO55042 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SncaO55042 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms