Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brs3O54798 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brs3O54798 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms