Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r2O35926 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r2O35926 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms