Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1dO35473 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1dO35473 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1dO35473 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1dO35473 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1dO35473 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1dO35473 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1dO35473 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1dO35473 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1dO35473 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1dO35473 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1dO35473 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C1dO35473 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C1dO35473 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1dO35473 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1dO35473 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1dO35473 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1dO35473 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1dO35473 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1dO35473 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1dO35473 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1dO35473 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1dO35473 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1dO35473 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms