Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dgcr6O35347 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Dgcr6O35347 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Dgcr6O35347 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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Dgcr6O35347 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Dgcr6O35347 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Dgcr6O35347 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Dgcr6O35347 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dgcr6O35347 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms