Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pkd2O35245 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pkd2O35245 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkd2O35245 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms