Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptpn9O35239 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Ptpn9O35239 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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Ptpn9O35239 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ptpn9O35239 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ptpn9O35239 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ptpn9O35239 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Ptpn9O35239 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptpn9O35239 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Ptpn9O35239 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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