Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrkcshO08795 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms