Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna5O08543 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna5O08543 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna5O08543 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Efna5O08543 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efna5O08543 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms