Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm20939L7N243 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm20939L7N243 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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