Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm4312K9J7E2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm4312K9J7E2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms