Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vwa3bJ9JI28 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vwa3bJ9JI28 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms