Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2056J3QQ02 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms