Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccer2J3QPU5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms