Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm21972J3QN38 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm21972J3QN38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm21972J3QN38 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm21972J3QN38 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm21972J3QN38 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm21972J3QN38 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm21972J3QN38 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm21972J3QN38 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm21972J3QN38 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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