Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21060J3KMU4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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