Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20830J3KML6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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