Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lcG5E8I7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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