Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms