Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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