Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms