Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-1G3UXB3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms