Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Srp72F8VQC1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp72F8VQC1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms