Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9yF8VPU6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp9yF8VPU6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms