Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28048F7BCN0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28048F7BCN0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms