Protein–RNA interactions for Protein: F2Z472

Svs3a, Seminal vesicle secretory protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs3aF2Z472 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Svs3aF2Z472 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs3aF2Z472 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Svs3aF2Z472 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Svs3aF2Z472 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Svs3aF2Z472 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Svs3aF2Z472 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs3aF2Z472 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs3aF2Z472 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs3aF2Z472 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs3aF2Z472 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms