Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Taf4E9QAP7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms