Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A430078G23RikE9Q7Y4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A430078G23RikE9Q7Y4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms