Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdhr2E9Q7P9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdhr2E9Q7P9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms