Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp3E9Q1T6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms